Open Babel has a NULL pointer dereference in CDXML OBAtom::GetExplicitValence
Summary
A memory-safety vulnerability in Open Babel's CDXML file format parser caused a NULL pointer dereference when reading a crafted input file.
Details
The flaw was in OBAtom::GetExplicitValence as called from the CDXML
parser. A malformed fragment caused the parser to invoke the method
on a NULL atom pointer.
Impact
Open Babel is a C++ library and CLI used to read and write chemistry
file formats; it is shipped by Linux distributions and embedded in
services that may parse untrusted input. Triggering this vulnerability
requires the victim to open a malicious CDXML file with the obabel
tool, the OBConversion API, or any of the language bindings (Python,
Ruby, Java, R, Perl, C#, PHP).
Affected versions
All releases up to and including 3.1.1.
Patched version
3.2.0 (released 2026-05-26).
Patch
Fix commit: https://github.com/openbabel/openbabel/commit/e23a224b Tracked in #2862.
A minimized reproducer for this CVE is checked in under
test/files/fuzz_regress/ and is exercised on every CI build under
ASAN+UBSAN by the fuzzregresstest harness.
Credit
Reported by Vedant Madane (@VedantMadane) via VulDB.
Czego dotyczy
Kliknij technologię, aby zobaczyć wszystkie dotyczące jej podatności.
| Platforma | Paczka | Podatne wersje | Poprawka w wersji |
|---|---|---|---|
| Python (PyPI) | openbabel | < 3.2.0 | 3.2.0 |
Odnośniki
- https://github.com/openbabel/openbabel/security/advisories/GHSA-rxpr-wq63-jr7p
- https://nvd.nist.gov/vuln/detail/CVE-2026-3408
- https://github.com/openbabel/openbabel/issues/2848
- https://github.com/openbabel/openbabel/pull/2862
- https://github.com/VedantMadane/openbabel/commit/e23a224b8fd9d7c2a7cde9ef4ec6afb4c05aa08a
- https://github.com/oneafter/0128/blob/main/ob3/repro.cdxml
- https://github.com/openbabel/openbabel
- https://vuldb.com/?ctiid.348303
- https://vuldb.com/?id.348303
- https://vuldb.com/?submit.763756
- https://pypi.org/project/openbabel
- https://github.com/advisories/GHSA-rxpr-wq63-jr7p
- Wektor CVSS
CVSS:3.1/AV:L/AC:L/PR:N/UI:R/S:U/C:N/I:N/A:H- Słabość (CWE)
CWE-476- Platforma
- Python (PyPI)
- Paczka
openbabel- Ujawniono
- 30.06.2026
- Aktualizacja
- 11.10.2026 14:17
Źródła i licencje
OSV / GitHub Advisory Database - PYSEC-2026-2791 - PyPA Advisory Database; CC BY 4.0
OSV / GitHub Advisory Database - GHSA-rxpr-wq63-jr7p - CC BY 4.0
Historia podatności: openbabel
Wszystkie opisane podatności tej paczki (Python (PyPI)), od najnowszej. Widać, czy to jednorazowa wpadka, czy paczka, której trzeba pilnować.
- Wszystkich wpisów
- 24
- Pierwsza → ostatnia
- 06.2026 07.2026
- Bez poprawki
- 0
- Wykorzystywana w atakach
- 0
Rozkład istotności
- Wysoka 16
- Średnia 2
- Niska 6
Ujawnienia w latach
- 2026: 24
-
Open Babel has a NULL pointer dereference in CDXML OBAtom::GetExplicitValence ten wpis
Dowiedz się, które podatności dotyczą Twojej aplikacji
Po podłączeniu integracji DockRay i włączeniu raportowania oprogramowania DockRay porównuje zgłoszone wersje komponentów ze znanymi podatnościami i powiadamia o potwierdzonych dopasowaniach. Zakres zależy od obsługiwanej technologii i dostępnych biuletynów.